La misión de la Escuela de Medicina de la Universidad de Valparaíso es formar y capacitar a través de sus actividades de docencia, investigación y extensión, los profesionales médicos cirujanos para atender adecuadamente los intereses y necesidades de la comunidad nacional y de la V región en particular, contribuyendo con ello a su mayor bienestar y desarrollo, en los ámbitos de promoción, prevención, terapéutica y recuperación de la salud, en coherencia con la misión institucional.

Además de esta misión educativa en salud, propia de la Universidad, se conjugan acciones relacionados con la misión de los Servicios e Instituciones de Salud regionales y nacionales, realizando prestaciones orientadas hacia la comunidad en la cual estamos insertos.